La Fundación Universidad Carlos III, creada el 18 de diciembre de 1990, es una Institución de carácter privado sin ánimo de lucro que tiene como objetivo básico la promoción y financiación de actividades de interés social de carácter científico y cultural, canalizando las relaciones entre la sociedad y la Universidad Carlos III de Madrid.
Asimismo, la Fundación colabora con la UC3M en la promoción, gestión y administración de algunos de sus servicios y actividades.